Dalam rangka meningkatkan keimanan dan ketaqwaan kepada Allah S.A.W, serta menanamkan nilai-nilai keagamaan khususnya agama Islam, kepada anak agar dapat diamalkan serta dibiasakan dalam praktek kehidupan sehari-hari, maka SDN Karanggeneng 01 mengadakan kegiatan Pesantren Kilat.
Kegiatan yang berlansung selama 3 hari, mulai Rabu, 8 Agustus 2012 dan berakhir pada hari Jumat, 10 Agustus 2012 diawali dengan kegiatan penerimaan dan pendistribusian Zakat fitrah kepada yang berhak menerima.
Peserta pesantren mulai kelas IV sampai dengan kelas VI. Pematerinya dari guru-guru SDN Karanggeneng 01. Materi disampaikan dengan menggunakan multi metode dan multi media, sehingga dapat memberikan stimulus kepada peserta,
dan dapat mengusir rasa kejenuhan. Jadwal kegiatan terakhir adalah berbuka bersama, diikuti oleh semua peserta dan juga dihadiri oleh Komite Sekolah.